《西藏善后章程》，又称《酌定西藏善后章程十三条》，是中国清朝政府于1751年(乾隆十六年)颁布的整顿西藏政治体制的章程。

　　1747年(乾隆十二年)，原西藏多罗郡王颇罗鼐病故，其次子珠尔默特那木札勒袭封郡王。珠尔默特那木札勒“素不信奉达赖喇嘛，心怀仇隟”，表面上顺从清朝派遣的驻藏大臣，暗中联络蒙古准噶尔汗国，伺机起兵反叛。1749年(乾隆十四年)，珠尔默特那木札勒攻杀其长兄“阿里公”珠尔默特策布登，控制了阿里。

　　1750年(乾隆十五年)，驻藏大臣傅清、拉布敦迫于情势，诱杀珠尔默特那木札勒，随后为其党羽卓呢尔(官名)罗卜藏札什所杀。随后，清朝廷派四川总督策楞领兵入藏平叛。为了更好地治理西藏，以及削弱世俗贵族的权势，根据乾隆帝的指示，策楞拟定《西藏善后章程》十三条，对西藏的行政体制进行了一系列改革。章程废除了西藏郡王制，设立噶厦，驻地在拉萨大昭寺，长官为噶伦，秉承驻藏大臣、达赖喇嘛旨意办事。其同时规定噶伦员额为四人，且必须于公所(噶厦)办理政事。“查旧例噶隆会办事件，原有噶沙之公所衙门。自颇罗鼐后，各噶隆竟不赴公所，俱于私宅办事。……今噶隆业已照例补放，自应遵照旧例，遇有应办事件，俱赴公所会办。”

　　章程扩大了驻藏大臣的职权，并首次正式规定了达赖喇嘛的世俗权力，形成了驻藏大臣、达赖与班禅的僧官系统、噶厦俗官系统三者制衡的状态。驻当雄的达木和硕特八旗蒙古军队亦归驻藏大臣统辖。1751年，清政府颁行策楞所奏的《西藏善后章程》。在进行体制改革的同时，清政府还决定在西藏长年驻兵一千五百名，令提督大员率领弹压，三年轮换一次，成为定例。