1939年11月12日至20日在重庆召开国民党五届六中全会。会议制定了军事,政治,经济,党务,教育规划;决定于1940年11月12日召开国民大会;选举蒋介石兼任行政院院长,孔祥熙为副院长。
1939年11月中旬召开的国民党五届六中全会,适值第一次长沙会战之后。为进一步消耗日军,准备于11月下旬至12月上旬,全面对日军发动冬季攻势。蒋介石重申了第二次南岳军事会议的一直要打到欧战结束的战略思想,并强调在此期间,中国要从各方面加强自己的力量。
五届六中全会通过了《加强经济斗争以粉碎敌人“以战养战”阴谋案》,认为“二期抗战,政治重于军事,而经济斗争又为政治斗争之主要部门”,确定了:甲,统制贸易,严禁走私,并切实抢购物资。乙,保护及发展农村经济,并提倡小工业。丙,破坏敌伪生产建设。
五届六中全会确定了对中国共产党的方针由政治限制为主转为军事限制为主,为掀起抗日战争时期的第一次反共高潮作准备。